Die sjokolade allergieë is moontlik, selfs al is dit skaars. Die allergiese verskynsel kom in hierdie geval van die proteïene van die kakao. Die allergiese persoon wat dit verbruik, ondervind dan asemhalingsprobleme, hoofpyn, uitslag, tagikardie, jeuk en 'n brandende gevoel in die maag.

Hierdie simptome kan ook waargeneem word by mense wat allergies is vir die elemente van sjokolade (neute, melkproteïene, ens..), alhoewel hulle dus nie regtig allergies is vir kakao nie.